Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.3Q85ZW6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms