Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco5bQ80X59 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmco5bQ80X59 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms