Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.4 ms