Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SnupnQ80W37 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnupnQ80W37 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms