Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll4Q80V24 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll4Q80V24 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms