Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sestd1Q80UK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms