Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cep170bQ80U49 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cep170bQ80U49 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms