Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CyldQ80TQ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CyldQ80TQ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CyldQ80TQ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms