Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tnfsf18Q7TS55 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf18Q7TS55 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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