Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ShprhQ7TPQ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 389.3 ms