Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms