Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp3Q7TNH6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms