Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf139Q7TMV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms