Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf2Q7TMI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms