Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vma21Q78T54 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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