Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mindy1Q76LS9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mindy1Q76LS9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mindy1Q76LS9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms