Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpv1Q704Y3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv1Q704Y3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms