Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spcs3Q6ZWQ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms