Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RfflQ6ZQM0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms