Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup188Q6ZQH8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup188Q6ZQH8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup188Q6ZQH8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup188Q6ZQH8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup188Q6ZQH8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup188Q6ZQH8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms