Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ino80Q6ZPV2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Ino80Q6ZPV2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms