Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx55Q6ZPL9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx55Q6ZPL9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx55Q6ZPL9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx55Q6ZPL9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx55Q6ZPL9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx55Q6ZPL9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx55Q6ZPL9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx55Q6ZPL9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx55Q6ZPL9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms