Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fmnl3Q6ZPF4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fmnl3Q6ZPF4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fmnl3Q6ZPF4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms