Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a1Q6X893 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms