Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn5Q6VZZ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn5Q6VZZ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms