Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casc1Q6TDU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms