Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300aQ6SJQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300aQ6SJQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300aQ6SJQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms