Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja6Q6S5G4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms