Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr12Q6QNU9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlr12Q6QNU9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlr12Q6QNU9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms