Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc57Q6PHN1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms