Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrm2bQ6PEE3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrm2bQ6PEE3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms