Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp12Q6P5B0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp12Q6P5B0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms