Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2aQ6P4T0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2aQ6P4T0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms