Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig8Q6P3A4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms