Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab6Q6P1E8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Efcab6Q6P1E8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab6Q6P1E8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms