Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc189Q6NZQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc189Q6NZQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms