Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms