Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Soga3Q6NZL0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms