Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SphkapQ6NSW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SphkapQ6NSW3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms