Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdcd11Q6NS46 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pdcd11Q6NS46 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms