Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms