Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ParpbpQ6IRT3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ParpbpQ6IRT3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms