Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf8Q6DID3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf8Q6DID3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms