Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smarca2Q6DIC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Smarca2Q6DIC0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smarca2Q6DIC0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca2Q6DIC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms