Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6DFW0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6DFW0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6DFW0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6DFW0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6DFW0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6DFW0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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