Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV8

Vwde, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwdeQ6DFV8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VwdeQ6DFV8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VwdeQ6DFV8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VwdeQ6DFV8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VwdeQ6DFV8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VwdeQ6DFV8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VwdeQ6DFV8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms