Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep290Q6A078 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep290Q6A078 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep290Q6A078 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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