Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swap70Q6A028 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms