Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk13Q69ZA1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms