Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn4Q69Z26 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn4Q69Z26 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms